Der Fehler „Failed to read auto-increment value from storage engine“ wird durch einen Bug in MySQL-Datenbanken der Version 5.x verursacht. Mir ist dieser Fehler bei der Verbindung von Hibernate mit einer InnoDB-Datenbank-Tabelle aufgefallen. Beim Datenbanktyp „MyISAM“ tritt dieser Bug wohl weniger häufig auf.
Man kann das Ganze wieder in Ordnung bringen, indem man folgenden SQL-Befehl ausführt:
ALTER TABLE `tabellen_name` AUTO_INCREMENT =1